密封蓋的細胞培養瓶提供密閉的細胞培養環境，若需要與培養箱中空氣聯通，需要在培養瓶放入培養箱后，將瓶蓋略微擰松，以允許空氣進入。同樣在取出時，需要先將瓶蓋擰緊再取出。帶濾膜的蓋子本身具有透氣的功能，濾膜可防止微生物污染，因此在使用時直接將瓶蓋擰緊放入培養箱即可，但需要注意不能將瓶蓋上的濾膜打濕，濕的濾膜無法確保氣體通過。